建筑工程系下设3个专业：建筑工程技术专业、工程造价专业、建筑室内设计专业。

建筑工程技术专业是学院的“老牌”专业，专业开办30多年来为京郊培养了4000余名技术管理人才，为京郊的现代化建设发挥了重要作用。该专业多年参加全国职业院校技能大赛“工程测量”赛项和“建筑工程识图”赛项，共获得全国二等奖等11项奖励。

工程造价专业是在建筑工程技术专业基础上开办的，近年来从企业引进了注册造价工程师作为专业的学科带头人，打造了一个实践性强的“双师型”教师队伍。

我院是北京市第一所开办建筑室内设计专业的高职院校。该专业与多家知名企业建立了长期合作关系，如北京居然之家、室内设计联盟等，为今后实践教学和就业奠定了良好的基础。